EoSonicTM FRAG96非接触式聚焦超声打断仪采用ACU(Adaptive cylindrical ultrasonic)超声聚焦技术,对提取后的核酸/染色质或培养后的细胞进行处理,通过调整声波参数调节核酸的打断长度。由于物理超声剪切无序列偏好性,对比酶切产生片段相对较窄(200-600 bp),可作为样品片段化处理的最佳选择。
EoSonicTM FRAG96灵活处理1~96个样本/批,可使用96孔PCR板、八联排管等不同规格的开放耗材,运行不同通量样本均只需较低的耗材成本。在使用过程中,无需将样品人工更换至专用耗材,可对样本进行整板转移便于自动化。仪器可用于DNA/RNA剪切,蛋白提取,细胞裂解,组织破碎,混合物溶解,蛋白酶消化反应等。
基因组DNA(gDNA)打断,用于NGS检测
染色质打断,用于ChIP测定
处理细胞或组织样本,用于提取核酸
处理细胞或组织样本,用于提取蛋白质
可兼容难以处理样本,如神经元,FFPE样本、巨噬细胞、脂肪组织、植物组织等
通量高:单一批次最高可处理96个样品
低噪音:超高工作频率,运行中无振动无噪音
灵活性:样本及耗材通量可灵活选择:1~96个样品
免转板:核酸提取物、细胞培养物可无需转板,直接上机打断
非接触:非接触式处理方式,完全独立封闭反应体系,可避免样本间的污染兼容性:无需专用耗材,可采用实验室中常见的孔板,八联排管及单独PCR管无边缘效应:所有位置打断效果保持高度一致
耐疲劳:可长时间连续工作
目前基因组测序进行文库构建第一步就是基因组DNA的片段化,常见的两种方法是酶切法和超声波打断。
酶切法是利用限制性内切酶特异性识别并切割磷酸与脱氧核糖之间的化学键,需要控制酶切时间和酶量。样本需求量少,产率高,但是实验成本较高,耗时长,并且存在序列偏好性。超声波打断是将DNA暴露于均匀的超声体系中进行无偏剪切,从而产生的大量均匀大小的双链DNA。操作简单,耗时短,效率和安全性高,并且无交叉污染,样本需求量小。
传统的超声打断仪使用探头对样品进行接触式超声打断,引起的超声波震动现象只能在靠近探头的位置比较明显,并且反复使用同一探头与多个样品接触,容易造成交叉污染。而非接触式超声打断仪利用超声波发生器,可以使整个水槽完全处于超声波的作用范围内,超声作用分布广泛而且均衡,样品所有位置打断效果可保持高度一致性,并且超声发生器不直接与样品接触,完全独立封闭反应体系,不会造成样品交叉污染。
普通超声打断是通过超声波发生器,仪器将电信号转变为超声波信号,超声波信号引起水中产生大量水分子空泡,这种空泡由于压力的迅速变化,因此会在几微秒内变大,破裂,破裂产生的瞬时流体剪切力,经过等温、非接触的方式对DNA样本进行打断和混匀。聚焦超声打断是在普通超声打断的优势基础上,采用超声换能器,它会旋转移动以平衡不聚焦带来的效果偏差,使产生的超声波无限接近于柱面波,场能分布更加均匀,因此无边缘效应,所有位置打断效果保持高度一致,打断效果更好。
无需专用耗材,可采用实验室中常见的孔板,8联排管或单独PCR 管或96孔板等