我们强烈建议遵循列出的芯片处理重要预防措施，以保持生物芯片的功能和完整性。
来自斯普雷格-道利大鼠胚胎E17-18的海马或皮层神经元。
胚胎在无菌条件下根据已发布的协议1被取出并解剖，然后通过在37°C下使用胰蛋白酶或木瓜蛋 白酶进行15-20分钟的酶消化来分离皮层和海马。最后，使用火抛光的巴斯德吸管进行研磨。
在灭菌之前，如果芯片已经干燥很长时间，我们建议用去离子水填充腔室，并重新水合1-2小时 。
BioChip腔体用70%的乙醇填充20分钟，冲洗4-5次无菌去离子水，然后在层流罩下干燥。由于紫外线 或高压灭菌方法可能会损坏BioChip，因此不使用这些方法。同时避免将整个芯片浸入乙醇中，以免 影响设备基材。更长时间的乙醇灭菌或使用更高浓度的乙醇可能会影响BioChip的功能。
建议使用三种不同的涂层：
建议的滴液体积为 BioChip4096S 的 30 µL，以及 BioChip4096S+ 和 BioChip4096E 的 90 µL。
对于标准培养，神经元被铺在BioChip4096S上，使用30-40 µL的液滴，包含名义上30,000到60,000个 细胞（~1,000-1,500细胞/µL）在活跃区域。对于BioChip4096S+和BioChip4096E，液滴应为80-90 µL ，并保持相似浓度，即~1,000-1,500细胞/µL。然后将BioChip放入培养箱中，经过3-5小时后，腔室中 加入~1.5 ml培养基（1% Glutamax，2% B-27补充的Invitrogen神经基础培养基）。
培养物在37°C的湿润温度下保持在5% CO2，95%空气中。每周更换三分之一到一半的培养基以平衡蒸发。为了避免强蒸发导致的渗透压失衡，BioChip可以与一个装有2 mL无菌水的小开口培养皿一 起放在一个培养皿中（此外，封闭的培养皿可以在边缘用一层薄薄的石蜡膜密封）。每2-3天视觉检查pH值；如果培养基颜色表明酸化过程（从粉红色转变为橙黄色），则预计会更换培养基。
记录后，BioChip 用去离子水（DDW）冲洗，然后使用软刷和清洁剂如 WPI-Enzol（WPI）或 TergA-zyme（Alconox）轻轻清洁。最后，BioChip 用去离子水（DDW）充分冲洗。
一旦生物芯片干燥后，可以将其存放在一个封闭的盒子中，以保护记录区域免受灰尘和污垢的影响 。