核心科学问题
三维脑模型(急性脑切片、类器官、脑球体)的电生理记录面临三大挑战:
- 平面电极无法穿透组织内部,只能记录表层信号,丢失深层网络信息
- 组织贴附电极底部后阻碍液体交换,导致底层细胞缺氧、活性快速下降
- 药物扩散慢,难以快速观察化合物对网络活动的调控效应
3Brain 的 3D HD-MEA 芯片通过数千根微米级针状电极(µneedle)直接刺入组织,同时针底形成微通道网格,为液体、氧气和化合物扩散留出通道——这代表了 MEA 技术的一次重要迭代。
技术方案
芯片设计:
- 4096 个电极排列成 64×64 网格(3.8 × 3.8 mm²),电极间距 60 µm
- 两种 µneedle 规格:大针(90 µm 高,26 µm 宽)用于切片;小针(65 µm 高,14 µm 宽)用于类器官
- 针底有金制底座(pedestal),与组织接触时形成微通道,底部不与芯片完全贴合
- 每根电极集成放大和复用电路,同时记录 4096 通道 @ 20 kHz
- 电极支持双向操作:记录 + 电刺激
验证模型:
- 急性小脑切片(220 µm)和皮质-海马切片(320 µm)
- 原代胚胎神经元来源的脑球体(400-600 µm)
- 人 iPSC 来源的皮层类器官(DIV 219)和脊髓类器官(DIV 131)
关键实验数据
1. µneedle 成功穿透组织

- 大针穿透小脑切片约 1/3 厚度(~70 µm),组织保持完整,无弯曲变形
- 小针完全穿透脑球体,球体保持球形结构,无明显细胞脱落
- 双光子显微镜确认 µneedle 深入组织内部,不破坏组织结构
2. 组织活性显著提升

- 微通道设计使底层细胞存活率从 38%(平面芯片)提升至 76%(3D HD-MEA)
- 微通道越宽(接触面积越小),活性越高
- VSDi 电压敏感染色确认 µneedle 不破坏网络功能连接
- 苔藓纤维刺激引发的颗粒层响应面积无显著差异(43.7% vs 39.7%, p=0.66)
3. 记录能力大幅提升
小脑切片:

| 指标 | 平面 HD-MEA | 3D HD-MEA | 提升 |
|---|---|---|---|
| 活跃电极数 | 390 ± 49 | 790 ± 62 | +103% |
| 分选细胞数 | 371 ± 45 | 668 ± 39 | +80% |
| 平均放电率 | 25 ± 1.8 Hz | 51 ± 5.4 Hz | +105% |
| 峰峰振幅 | 76 ± 5 µV | 111 ± 9 µV | +46% |
皮质-海马切片:

- 活跃电极数提升 92%(56 vs 154)
- 峰峰振幅提升 105%(166 vs 257)
4. 药物作用加速

- TTX 灌流后,3D HD-MEA 上小脑切片放电率下降速度显著快于平面芯片(p < 0.0001)
- 微通道允许灌流液从底部快速扩散,缩短药物作用时间
- 对药筛应用意义重大:更快获得剂量-效应关系
5. 电刺激能力

- 3D HD-MEA 通过相邻电极释放双相电刺激,成功引发苔藓纤维-颗粒层-LFP 响应
- 信号传播速度 311 ± 39 mm/s
- 平面 HD-MEA 相同协议未能激活颗粒层
- 普肯野细胞 burst-pause 响应证明刺激通过突触有效传播
- NBQX(AMPA 受体阻断剂)消除响应,证实突触传递机制
6. 前额叶皮层自发网络活动

- 生理条件下记录到 983 个活跃通道,占 PrL 区 43% 的电极
- 4/7 切片在 gabazine 灌流后出现传播性 LFP 事件(类癫痫样放电)
- 相关分析显示两组切片基础网络连接水平不同
- 证明了 3D HD-MEA 在难记录脑区的应用潜力
7. 脑球体和类器官记录
脑球体:

- 大小球体均可立即检测到尖峰和爆发活动
- 相邻球体虽共享培养基但活动不同步,各自独立
- 大球体穿透更多 µneedle,活跃电极数更多
- "活跃细胞/覆盖电极"比值相似(~1.5),说明穿透效率不受球体大小影响
类器官:

- 219 天皮层类器官检测到数百个活跃位点,出现自发放电和爆发
- 高度同步的网络激活提示功能性网络形成
- 1 mM KCl 增加放电率 18%、爆发率 14%
- 5 mM KCl 破坏网络同步性,出现强直放电
创新点
- 首个整合穿透能力 + 高密度记录 + 电刺激 + 组织存活的 3D MEA 平台
- 微通道设计同时解决组织存活和药物扩散两个痛点
- 从急性切片到类器官,跨多种 3D 模型验证通用性
- 4096 通道同时记录 + 20 kHz 采样率,时间和空间分辨率兼具
行业启示
对于使用类器官/脑切片进行功能药筛的实验室,3D HD-MEA 提供了一种从"只能看表层"到"深入组织内部"的解决方案。相比传统平面 MEA,它在记录质量、组织活性、药物扩散速度三个维度上都有显著提升,特别是在需要高通量电生理筛选的场景中优势明显。
不过,对于预算有限的实验室,也可以考虑先用平面 HD-MEA 满足基本需求,等样本量和经费允许后再升级 3D 版本。
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文献信息
| 字段 | 内容 |
|---|---|
| PMID | 40906696 |
| 标题 | Enhanced electrophysiological recordings in acute brain slices, spheroids, and organoids using 3D high-density multielectrode arrays |
| 期刊 | PLoS One, 2025, 20(9): e0328903 |
| DOI | 10.1371/journal.pone.0328903 |
| 作者 | Mapelli L, Di Domenico D, Sciacca G, Mainardi F, Ottaviani A, Monteverdi A, Tedesco M, Battaglia CR, Tritto S, Gandolfo M, Imfeld K, Kiderlen S, Krainer L, Cervetto C, Marcoli M, Sing A, Andersen J, Birey F, Sloan SA, Maccione A, D'Angelo E |
| 机构 | University of Pavia; 3Brain AG, Switzerland; IRCCS Mondino Foundation; Emory University, USA 等 |
| 发表时间 | 2025-09-04 |
| PMC | PMC12410755 |
联系人|李东伟
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